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肿瘤SNV 5% gDNA标准品Ⅱ

货号 单位规格 库存 浓度
GW-OGTM006 1 µg/支 9999 30 ng/μL
  • 简介
二代测序（NGS）平台是目前基于测序手段研究人类基因组的最主要平台。然而，由于样本差异，建库方法不同，测序平台偏差，生物信息分析流程各异等一系列因素的限制，结果准确性没有统一标准。 菁良科技的多重组合标准品适用于 NGS 全过程：从文库制备，上机测序，到信息分析；同时适用于各测序方法：全基因组，全外显子组，目标区域，定制捕获和靶向扩增子组等测序。                            
肿瘤SNV 5% gDNA标准品Ⅱ是一种高度特征化，生物学相关的质量控制材料，涵盖多个基因变异，包含了经过 ddPCR 验证的10个 SNV 、2个插入突变和1个缺失突变及1个融合相关变异 ，用于评估 NGS 流程的性能，有助于修正和监测您的实验方案、操作规范及生物信息学流程等，并进行后续的一系列应用。                     
  • 产品信息
  • 应用领域
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保存溶剂 Tris-EDTA (10mM Tris-HCl, 1mM EDTA), pH 8.0
存储温度 2-8˚C
保质期 36个月
检测项目 检测方法 质量标准
等位基因突变频率/基因型 微滴式数字PCR AF=0%, 可接受范围 ≤0.1%； AF＜5%，可接受误差范围 = ±30%； 5%≤AF＜10%, 可接受误差范围 = ±20%； 10%≤AF, 可接受误差范围 = ±10%
完整性 琼脂糖凝胶电泳 电泳条带单一，明亮
浓度 Qubit® 4.0 Fluorometer 30 ng/µL±15%
序号 突变类型 基因位点 CDS突变 突变频率/拷贝数 COSMIC编号 (COSMIC v96) 染色体编号 染色体位置（GRCh38）
1 SNV BRAF V600E c.1799T＞A 8% COSM476 7 140753336
2 SNV EGFR L858R c.2573T＞G 5% COSM6224 7 55191822
3 Deletion EGFR E746_A750del c.2235_2249del15 5% COSM6225 7 55174773-55174787
4 Insertion EGFR A767_V769dup c.2300_2308dup 5% COSM12376 7 55181317
5 SNV EGFR T790M c.2369C＞T 5% COSM6240 7 55181378
6 SNV EGFR G719A c.2156G＞C 5% COSM6239 7 55174015
7 SNV KRAS G12C c.34G＞T 5% COSM516 12 25245351
8 SNV KRAS G13D c.38G＞A 5% COSM532 12 25245347
9 SNV NRAS Q61R c.182A＞G 5% COSM584 1 114713908
10 SNV PIK3CA H1047R c.3140A＞G 5% COSM775 3 179234297
11 SNV PIK3CA E545K c.1633G＞A 5% COSM763 3 179218303
12 SNV MET Exon 14 Skipping c.3082+1G＞T 5% COSM6108462 7 116771990
13 Insertion ERBB2 Y772_A775dup c.2313_2324dup 5% COSM20959 17 39724742..39724743
14 SNV FGFR3 Y375C c.1124A＞G 5% COSM718 4 1804372
  • 评估检测流程的效率
  • 评估背景噪声对变异检测的影响
  • 验证生物信息学流程的稳健性
  • 优化和验证新的癌症panels，并监测流程性能
  • 探测流程的监测限和定量限
  • 分析检测流程的灵敏度，准确度和特异性
  • 比较各平台的检测差异

以下文件命名格式为产品货号-产品批次号-产品文件类型

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