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肺癌ctDNA标准品套装
货号 |
单位规格 |
库存 |
浓度 |
GW-OCTM009 |
0.5 μg/支*3 |
9999 |
20 ng/µL |
相比组织检测,液体活检方便,快速,即时,便宜,微创的特点,使其迅速成为目前肿瘤基因检测甚至是肿瘤早筛的研究热门。然而,由于DNA片段小,半衰期短,低丰度,肿瘤治疗过程中含量逐渐减少,正常细胞DNA污染,不同检测方法等一系列因素的限制,结果准确性没有统一标准。
菁良科技的ctDNA标准品适用于液体活检各过程:从文库制备,变异检测,到信息分析;同时适用于各检测方法:NGS 测序,PCR 检测等。
肺癌 ctDNA 标准品套装是一种高度特征化,生物学相关的质量控制材料。涵盖多个基因变异,包含了经过 ddPCR 验证的6个SNV、1个插入及1个缺失变异位点,且每个位点均含有0%、0.1%、1%三个梯度的突变频率,可用于最低检测限的验证及线性验证。助力 NGS 流程的性能评估,修正和监测您的实验方案、操作规范及生物信息学流程等应用。
存储温度 |
2-8℃ |
保质期 |
36个月 |
缓冲液 |
Tris-EDTA (10mM Tris-HCl, 1mM EDTA), pH 8.0 |
浓度 |
20 ng/µL |
规格 |
0.5 μg/支 |
检测项目 |
检测方法 |
质量标准 |
等位基因突变频率/基因型 |
微滴式数字PCR |
AF=0%,可接受范围 ≤0.1%;
AF<1%,可接受误差范围 = ±50%(0.1%位点检测到的AF值必须比对应野生型位点高至少0.05%);
1%≤AF<5%,可接受误差范围 = ±40%;
5%≤AF<10%,可接受误差范围 = ±30%;
10%≤AF,可接受误差范围 = ±20%;
拷贝数<5,可接受误差范围 = ±40%;
5≤拷贝数<10,可接受误差范围 = ±30% |
片段分布 |
4150 TapeStation System |
片段平均长度160bp±10% |
浓度 |
Qubit® 4.0 Fluorometer |
20 ng/µL±15% |
序号 |
突变类型 |
基因位点 |
CDS突变 |
突变频率/拷贝数 |
COSMIC编号 (COSMIC v96) |
染色体编号 |
染色体位置(GRCh38) |
1 |
SNV
|
EGFR L858R
|
c.2573T>G
|
0%,0.1%,1%
|
COSM6224
|
7 |
55191822 |
2 |
SNV
|
EGFR T790M
|
c.2369C>T
|
0%,0.1%,1%
|
COSM6240
|
7 |
55181378
|
3 |
Insertion
|
EGFR A767_V769dup
|
c.2300_2308dup CCAGCGTGG |
0%,0.1%,1%
|
COSM12376
|
7 |
55181317-55181318
|
4 |
Deletion
|
EGFR E746_A750del |
c.2235_2249del15
|
0%,0.1%,1%
|
COSM6223
|
7 |
55174772-55174786 |
5 |
SNV
|
KRAS A146T
|
c.436G>A |
0%,0.1%,1%
|
COSM19404
|
12 |
25225628
|
6 |
SNV
|
KRAS G12D |
c.35G>A
|
0%,0.1%,1%
|
COSM521
|
12 |
25245350
|
7 |
SNV
|
NRAS Q61K
|
c.181C>A |
0%,0.1%,1%
|
COSM580 |
1 |
114713909
|
8 |
SNV
|
PIK3CA E545K
|
c.1633G>A
|
0%,0.1%,1%
|
COSM763
|
3 |
179218303
|
- 准确性验证
-
重复性检测
-
稳定性验证
-
检测极限确定
-
流程性能定期监测
-
评估背景噪声的干扰
-
不同类型变异检测能力确定
-
不同平台之间性能差异检测
以下文件命名格式为产品货号-产品批次号-产品文件类型
SMS-GW-OCTM009-A1 产品说明书: |
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GW-OCTM009-202112071-COA: |
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GW-OCTM009-202112071-产品实测值: |
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GW-OCTM009-202106002-COA: |
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GW-OCTM009-202106002-产品实测值: |
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GW-OCTM009-202106001-COA: |
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GW-OCTM009-202106001-产品实测值: |
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GW-OCTM009-202209061-产品实测值 (1): |
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GW-OCTM009-202209061-COA: |
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GW-OCTM009-202301051-COA: |
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