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ctDNA 标准品

产品背景及介绍

循环游离DNA(cfDNA)是释放到血浆中的降解的DNA片段。cfDNA包括各种形式的DNA,包括循环肿瘤DNA(ctDNA)和胎儿游离DNA(cffDNA)。ctDNA已被证明是癌症和胎儿医学以外的众多疾病的生物标志物,包括但不限于创伤,败血症,无菌性炎症,心肌梗塞,中风,移植,糖尿病和镰状细胞病等。

菁良科技生产的ctDNA标准品来源于具有完整溯源性文件的细胞系,通过基因编辑或者细胞筛选的方法得到具有明确突变位点细胞系。通过菁良科技稳定可靠的生产体系进行细胞的单克隆及传代培养,可稳定生产出遗传背景均一的模拟临床样本的ctDNA标准品。

菁良科技将具有明确突变位点及突变频率的gDNA通过特定的生产工艺进行混合及打断,可得到多种突变位点及频率的、约160bp的片段化ctDNA标准品。通过DdPCR验证,确保每一批生产的ctDNA标准品具有精确稳定的突变频率。

包含多个热门的癌种相关基因突变位点,如EGFR、KRAS、ALK、BRAF等基因。包含多种变异类型,如:SNV、插入/缺失、拷贝数变异/扩增、基因融合等。

包含多个单位点产品、多位点产品,其中ctDNA套装产品含AF为0%、0.1%、1%的标准品,便于检测限及精密度的线性验证。另外,菁良科技还可以提供对应的野生型,即用于阴性对照的ctDNA标准品。

产品用途

  • 评估检测流程的效率

  • 评估背景噪声对变异检测的影响

  • 验证生物信息学流程的稳健性

  • 优化和验证新的癌症panel,并监测流程性能

  • 探测流程的监测限和定量限

  • 分析检测流程的灵敏度,准确度和特异性

  • 比较各平台的检测差异

ctDNA片段分布

菁良科技2个ctDNA标准品及真实血浆游离DNA的片段分布对比,如下图所示:

成品-20190709.png

产品分类

菁良科技ctDNA标准品有如下几种:

  • 结构变异组合的阳性标准品

  • SNV变异组合的阳性标准品

  • 阴性对照品

产品信息

  • 产品形式:ctDNA

  • 保存溶剂:Tris-EDTA (10mM Tris-HCl, 1mM EDTA), pH 8.0

  • 产品规格:可定制

  • 浓度:20ng/μl

  • 储存温度:2-8˚C

  • 可定制位点:根据客户需求进行评估

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