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肿瘤突变负荷(TMB)质控品

| 产品背景及介绍

肿瘤突变负荷(Tumor Mutation Burden,TMB) 定义为一份肿瘤基因组中,所评估基因的外显子编码区每兆碱基中发生置换和插入/缺失突变的总数。TMB水平越高,代表着肿瘤细胞中能被免疫系统识别的肿瘤新抗原数量可能越多,因此TMB可以作为潜在生物标志物来预测免疫治疗的疗效。

菁良科技配对TMB质控品来源于同一病人样本的肿瘤细胞和白细胞,细胞经过传代培养后,按照一定比例混合制成FFPE,gDNA, ctDNA质控品。质控品进行WES测序,计算配对样本TMB值,及进行ddPCR验证。同时,可通过肿瘤和正常细胞的混合比例模拟不同肿瘤含量的临床样本。

| 产品特点

高度模拟病人样本的细胞来源质控品

gDNA/FFPE蜡块/ctDNA等丰富的产品形式

经过国内外多家NGS检测公司测试,结果稳定一致

提供成对质控品用于过滤胚系突变

提供完整的WES 测序数据、TMB参考值及生信流程

配对质控品TMB值覆盖2到28多个梯度

可模拟不同肿瘤含量的临床样本

| 产品应用

相应分子检测实验质控品

优化和验证新的实验流程或试剂盒

检测实验方法的灵敏度,准确度和特异性

比较各平台的检测差异

| 产品信息

产品形式(定制):gDNA、ctDNA、FFPE蜡块

产品规格(定制):根据客户需求定制

突变检测方法:WES及数字PCR(PCR可选)

| 快定备货产品列表


序号
TMB参考值产品编码
产品名称gDNA来源
产品形式浓度规格
128CA0586TMB-1-T gDNA Reference Standard肿瘤细胞gDNA30ng/µl1μg/管
2CA0587TMB-1-N gDNA Reference Standard白细胞gDNA30ng/µl1μg/管

3

19.41CA0588TMB-4-T gDNA Reference Standard肿瘤细胞gDNA30ng/µl1μg/管
4CA0589TMB-4-N gDNA Reference Standard白细胞gDNA30ng/µl1μg/管
515.15
CA0590TMB-12-T gDNA Reference Standard肿瘤细胞gDNA30ng/µl1μg/管
6CA0591TMB-12-N gDNA Reference Standard白细胞gDNA30ng/µl1μg/管
713.02CA0592TMB-6-T gDNA Reference Standard肿瘤细胞gDNA30ng/µl1μg/管
8CA0593TMB-6-N gDNA Reference Standard白细胞gDNA30ng/µl1μg/管
96.1CA0594TMB-13-T gDNA Reference Standard肿瘤细胞gDNA30ng/µl1μg/管
10CA0595TMB-13-N gDNA Reference Standard白细胞gDNA30ng/µl1μg/管

以上产品我们也可提供上述肿瘤和正常细胞不同比例的混合样本。如有其它TMB值的定制需求,亦可联系技术支持或销售团队。


| 测序参数

测序策略:全外显子组测序(WES)

WES捕获芯片:IDT xGen Exome Research Panel v1.0(39M)

WES测序平台:Illumina HiSeq X Ten

WES数据质量:有效测序深度大于500X

| 基本流程

TMB流程1@300x.png

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